Большинство коренных американцев к востоку от реки Миссисипи, пострадавшие от войны, и многие общины были разделены вопросом о том, как реагировать на конфликт. Хотя некоторые племена были в дружеских отношениях с американцами, большинство коренных американцев выступают против Соединенных Штатов в качестве потенциальной угрозы для своей территории. Около 13000 Коренных американцев сражались на британской стороне, с большой группой ближайших от ирокезов племен, которые выставили около 1500 человек. Мощность ирокезов была разрушена в результате конфликта, хотя Конфедерация не принимала чью-либо сторону, Сенека, Онондага страны встали на сторону англичан. Члены Mohawk воевали на обеих сторонах. Многие Tuscarora и Oneida на стороне колонистов. Континентальная армия отправила Салливан экспедиции на рейдах по всему Нью-Йорку, которые были на стороне англичан. И во время и после войны трения между лидерами Mohawk Жозефа Луи Кука и Джозефа Бранта, которые встали на сторону американцев и британцев, соответственно, еще более усугубили раскол.

Крик и Сейминол союзники Великобритании воевали против американцев в Грузии и Южной Каролине. В 1778 году силой в 800 Creeks уничтожены американскими поселениями вдоль широкой реки в Грузии. К крик-воинам также присоединился Томас Браун, осуществлял рейды в Южной Каролине и помощь Великобритании во время осады Саванны. Многие коренные американцы были вовлечены в боевые действия между Англией и Испанией на побережье Мексиканского залива и вверх по реке Миссисипи, в основном, на британской стороне. Тысячи ручьев, чикасо, и чокто воевали в районе крупных сражений.